Основные причины, определившие развитие и углубление кризиса в аграрном секторе могут быть сведены в две группы. Первую по значению группу составляют факторы ухудшения внешних экономических условий для сельского хозяйства: возникновение и усиление диспаритета цен на сельскохозяйственную и промышленную продукцию, ухудшение условий реализации сельскохозяйственой продукции из-за ошибок в приватизации перерабатывающих предприятий, сокращение объемов реализации в итоге снижения платежеспособного спроса населения и роста продовольствия, сокращение, а по многим направлениям прекращение государственной поддержки, необеспеченность финансовыми и материальными ресурсами принимаемых федеральных программ.

Одновременно сформировалась и усиливает проявления кризиса группа внутренних причин. Среди них поспешность и ошибки при реформировании колхозов и совхозов, снижение интенсивности производства, переход к примитивным технологиям, в итоге снижение продуктивности и урожайности, медленная структурная перестройка производства, утрата экономических элементов во внутрихозяйственном механизме хозяйствования, низкая социально-трудовая активность работников сельского хозяйства.

Поэтому прежде всего необходимо осуществить меры общесистемного характера: снизить цены на топливно-энергетические ресурсы, транспортные тарифы, установить ставку процента за краткосрочный кредит на уровне средней рентабельности в отраслях материального производства. Это будет способствовать ослаблению диспаритета цен. Наряду с общими шагами требуется комплекс мер государственной поддержки сельского хозяйства, направленных на стабилизацию экономической ситуации.